Методы исследования и виды открытых состояний ДНК

📙 Открытые состояния ДНК возникают в результате высокоамплитудных флуктуаций её цепей и играют важную роль в репликации, а также во многих биохимических процессах. В данной монографии представлен подробный обзор экспериментальных данных по свойствам открытых состояний, а также описан ряд наиболее простых математических моделей, при помощи которых исследовалась динамика локальных открываний ДНК в широком интервале температур. Обсуждается роль каждой из групп моделей в интерпретации экспериментальных данных. Собран и проанализирован фактически весь экспериментальный материал по кинетике и термодинамике «углового» открывания одиночных пар оснований. Объяснены противоречия между результатами разных экспериментов. На основе различия термодинамических свойств и ряда других характеристик выделено три типа открытых состояний ДНК. На основе совокупного анализа экспериментального материала показано существование нового типа открытого состояния, «малого углового открывания». Дано современное определение термина «открытое состояние ДНК». Предложен ряд улучшений имеющихся на сегодняшний день теоретических и экспериментальных подходов в исследовании открытых состояний ДНК.