📓 Metodologias para la caracterizacion microscopica, bioquimica y molecular de cepas nativas de Bacillus thuringiensis (Bt) fueron estandarizadas. De esta manera, se evaluaron 336 aislamientos nativos, de los cuales 235 (70%) presentaron cristales parasporales. La caracterizacion bioquimica incluyo el analisis de los perfiles electroforeticos de proteinas totales de cultivos de Bt en fase estacionaria. Esta metodologia estandarizada se empleo para evaluar las 235 cepas nativas de Bt. El 87% de las cepas presentaron patrones electroforeticos claros, de estos el 77 mostraron bandas de proteinas con pesos moleculares similares a los de las cepas de referencia. El 23% de las cepas nativas presentaron bandas de proteinas distintas a las de las cepas de referencia y a las reportadas en la literatura. La caracterizacion molecular consistio en el analisis de los productos de la amplificacion de genes cry de las cepas nativas empleando la Reaccion en Cadena de Polimerasa (PCR). Se utilizaron 4 mezclas de oligonucleotidos; dos Generales (I y II) que permiten amplificar fragmentos de genes de las familias cry1, cry2, cry3, cry4 y cry1la y dos Especificas (A y B) que amplifican genes especificos.